Fiocruz y Vale invierten en secuenciación del genoma del coronavirus

El proyecto Genoma COVID-19 ya cuenta con 3.300 muestras catalogadas

Publicado en 17/07/2020 - 14:49 Por Cristina Índio do Brasil - Río de Janeiro

La Fundación Oswaldo Cruz (Fiocruz) del estado de Amazonas (noreste) y la empresa minera Vale, a través del Instituto Tecnológico Vale (ITV) de Belém, en Pará, han desarrollado el proyecto conjunto "Genoma COVID-19" para la secuenciación del genoma de las muestras del nuevo coronavirus (SARS-CoV-2).

Felipe Naveca, investigador y subdirector de Investigación e Innovación de Fiocruz Amazonia, dice que, desde mucho antes de la pandemia, las dos instituciones ya eran conscientes de la importancia de aunar esfuerzos para secuenciar el genoma de enfermedades emergentes, especialmente de los virus, para mantenerse en línea con una tendencia mundial: "La herramienta más importante para estudiar y comprender un nuevo virus es la tecnología del genoma. Estamos siguiendo una tendencia mundial, poniendo a Brasil en escena junto con otras iniciativas que se están llevando a cabo".

"Solo en Inglaterra hay más de 20.000 genomas, pero la inversión es cientos de veces mayor", dijo Naveca en una entrevista con Agência Brasil.

El ITV, señaló el investigador, cuenta con un notable laboratorio de biología molecular y un equipo de bioinformática enfocado en las ciencias de la vida: "El proyecto tiene como objetivo secuenciar de miles de muestras de coronavirus para que podamos comprender mejor el comportamiento de este virus en Brasil, cómo se propagó, cuántas veces se introdujo, mirando no sólo al país en su conjunto, sino a los estados, con un enfoque en el Norte, que históricamente tiene menos financiación en todos los campos de investigación", dijo.

Naveca agregó que el proyecto se suma al estudio que ya se venía realizando en Manaus con fondos de la Fundación de Apoyo a la Investigación del Estado de Amazonas (Fapeam) y Fiocruz. Ahora, la colaboración con Vale permitirá ampliar la iniciativa a otros estados e impulsar los estudios en la región norte. Aún según Naveca, ya se han establecido contactos con varios investigadores de otros estados para que también se unan al proyecto.

"[La forma] como se ha propagado en São Paulo y Río, en todo el sureste, puede haber sido diferente de lo que ocurrió en la región amazónica debido a múltiples factores. De hecho, aquí en Amazonas experimentamos un pico de la epidemia mucho antes que otros estados. Esto muestra nuestras diferencias, como el hecho de que tenemos una población indígena muy grande y hacemos frontera con otros países como Colombia y Perú. Así que tenemos un perfil epidemiológico diferente que, creo, también tiene que ver con la forma en que la epidemia se manifestó aquí en el Norte", señaló.

Mutación

Naveca observa que el protocolo ideal para diagnosticar el nuevo coronavirus es la prueba de PCR, que debe realizarse en los primeros días de los síntomas. Sin embargo, los que se utilizan en los estudios se desarrollaron fuera del país -en los Estados Unidos, China y Alemania- y arrojan luz sobre la diversidad del virus en esos lugares, y que no necesariamente se encuentra en Brasil, ya que el virus sufre mutaciones mientras contamina la población. El experto agregó que los esfuerzos futuros incluirán el análisis de si esas mutaciones causan impactos en los diagnósticos hechos en territorio brasileño.

"A corto plazo, esta es una de las cosas que nos permitiría mejorar el diagnóstico. Otra es investigar si hay otros virus similares circulando simultáneamente, una información que queremos aclarar para mejorar el diagnóstico", dijo Naveca.

El investigador explicó que la firma genética de cada virus permitirá a los científicos monitoriar su desarrollo. "Por ejemplo, aquí en Amazonas, cada vez que el virus entró en el estado, pasó por Manaus y desde Manaus se propagó a otros municipios... ¿Se ha introducido también en otros municipios? ¿Qué cepa del virus llegó a las zonas indígenas? ¿Es la misma que llegó a otras capitales? Estas son preguntas que esperamos ver respondidas durante nuestra investigación", dijo.

Naveca agregó que las pruebas que se produzcan como resultado de los estudios podrían tener características propias del comportamiento del virus en la población brasileña. En su opinión, algunos resultados negativos que se han visto en Brasil pueden en realidad ser falsos negativos, porque las pruebas de EE.UU., China y Alemania usan una variación diferente del virus. "Por lo tanto, quizás deberíamos tener una [prueba] más adaptada para los virus que están circulando en Brasil. Todavía no lo sabemos", dijo.

Contrato e inversión

El proyecto se encuentra todavía en su etapa inicial y más burocrática de ultimar los contratos, lo que debería terminar en una semana. Mientras tanto, continúa la labor que se venía realizando en Amazonas, que será incluida en el Proyecto del Genoma COVID-19 y ya cuenta con 3.300 muestras catalogadas. La ampliación depende, según Naveca, de cuántos investigadores de otros estados se unan a la iniciativa, bien como de otras fuentes de financiación.

En un primer momento, Vale invertirá US$ 424.000 en el estudio. "Con esos fondos, podemos hacer el proyecto con las 3.300 muestras iniciales, que con otros aportes pasarían a más de 4 mil muestras", dijo Naveca, subrayando que seis meses después de completada la etapa burocrática de firma de convenios, los primeros resultados pueden empezar a salir.

Medicamentos y vacunas

Para Guilherme Oliveira, director científico del Instituto Tecnológico de Vale, el mapeo genético también generará datos que servirán de base para los estudios de nuevos coronavirus que puedan surgir en el futuro.

Además, el Proyecto del Genoma COVID-19 también ampliará la red de investigación para el estudio de virus causantes de potenciales endemias y pandemias en Amazonas, como los arbovirus, incluidos los que causan el dengue, el chikungunya y el zika. "En el futuro, queremos hacer también la secuenciación genética de los arbovirus y, al igual que el SARS-CoV-2, estudiar su comportamiento celular, considerando su variabilidad genética, para el desarrollo de medicamentos y vacunas", dijo.

Vale informó que la investigación genética sobre el nuevo coronavirus cuenta con la participación de más de 50 investigadores y becarios, vinculados a centros de investigación y bioinformática en cinco ciudades diferentes, además de una red de colaboradores dentro y fuera del país.

Traducción: Lucas Magdiel -  Edición: Denise Griesinger/Nira Foster

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