Identifican una nueva variante del virus Sars-CoV-2 en tres estados
Se ha detectado en Brasil una nueva cepa del virus SARS-CoV-2 que ha comenzado a propagarse a nivel mundial. Denominada XEC, esta cepa pertenece a la variante Ómicron y ha sido identificada en los estados de Río de Janeiro, São Paulo y Santa Catarina.
El descubrimiento inicial fue realizado por el Instituto Oswaldo Cruz (COI/Fiocruz) en muestras de dos pacientes de Río de Janeiro diagnosticados con covid-19 en septiembre. Las secuencias genéticas fueron decodificadas y depositadas en la plataforma en línea Gisaid los días 26 de septiembre y 7 de octubre. Posteriormente, se registraron secuencias genéticas del linaje XEC en São Paulo, a partir de muestras recolectadas en agosto, y en Santa Catarina, con muestras de septiembre, subidas por otros grupos de investigación.
Seguimiento
El 24 de septiembre, la Organización Mundial de la Salud (OMS) clasificó la variante XEC como "bajo vigilancia". Esta clasificación se otorga a cepas que presentan mutaciones en su genoma que podrían afectar el comportamiento del virus, además de mostrar signos iniciales de una posible "ventaja de crecimiento" frente a otras variantes circulantes. La variante XEC comenzó a ganar atención en junio y julio de 2024 debido al aumento de detecciones en Alemania, expandiéndose rápidamente por Europa, América, Asia y Oceanía. Hasta el 10 de octubre, al menos 35 países habían identificado la cepa, con más de 2.400 secuencias genéticas subidas a Gisaid.
Paola Resende, investigadora del Instituto Oswaldo Cruz, explicó que los datos internacionales sugieren que la XEC podría ser más transmisible que otras variantes, pero es necesario evaluar su comportamiento en Brasil. "En otros países, esta variante ha mostrado mayor transmisibilidad, lo que ha incrementado la circulación del virus. Es crucial observar qué sucederá en Brasil, ya que la memoria inmunológica varía entre países debido a las diferentes cepas que han circulado previamente", afirmó.
Estrategia
La identificación de la variante XEC en Brasil se logró a través de una estrategia de vigilancia que aumentó la secuenciación de genomas del SARS-CoV-2 en Río de Janeiro durante agosto y septiembre. Durante tres semanas, se recolectaron muestras de hisopados nasales de casos positivos diagnosticados mediante pruebas rápidas en unidades básicas de salud. Las muestras fueron enviadas al Laboratorio de Referencia del COI/Fiocruz. Aunque se detectó la presencia de XEC, el monitoreo confirmó que la cepa predominante en el país sigue siendo JN.1, dominante desde finales del año pasado.
"Realizamos esta acción para entender en tiempo real lo que estaba ocurriendo en Río, donde se había registrado un leve aumento en los casos de covid-19. Esto fue fundamental para detectar la variante XEC, que ahora deberá ser monitoreada de manera continua", comentó la viróloga, quien además advirtió sobre la debilitación de la vigilancia genómica del SARS-CoV-2 en Brasil, subrayando la necesidad de mantener un monitoreo sistemático en todo el país.
Resende enfatizó: "En este momento, no contamos con datos genómicos de varios estados porque no se han recolectado ni enviado muestras para su secuenciación. Es esencial que el monitoreo sea homogéneo en todo el territorio para evaluar el impacto de la llegada de la variante XEC y detectar otras variantes que podrían cambiar el panorama del covid-19 en Brasil".
Además, destacó la importancia de los datos genómicos para ajustar la composición de las vacunas contra la covid-19. La OMS dispone de un comité de asesoramiento técnico que se reúne dos veces al año. En abril, se recomendó formular las vacunas basadas en la cepa JN.1, y la próxima reunión está prevista para diciembre.
Origen
Los análisis indican que la XEC surgió a través de un proceso de recombinación genética entre cepas previamente circulantes. Este fenómeno ocurre cuando una persona se infecta simultáneamente con dos cepas diferentes del virus. Durante la replicación viral, los genomas de ambas cepas pueden combinarse. El genoma de la XEC contiene fragmentos de las cepas KS.1.1 y KP.3.3, además de presentar mutaciones adicionales que podrían favorecer su propagación.
